據《藥師琉璃光如來本願功德經》記載，藥師佛在因地修持行菩薩道時，曾發十二大願
藥師佛十二大願
第一大願、 願生佛平等
願我來世得阿耨多羅三菩提時，自身光明，熾然照耀無量無數世界，以三十二大丈夫相，八十隨形好，莊嚴其身；令一切有情，如
我無異。
第二大願、 願開曉事業
願我來世得菩提時，身如琉璃，內外明徹，淨無瑕穢，光明廣大，功德巍巍，身善莊嚴，過於日月；幽冥眾生，悉蒙開曉，隨意所
趣，作諸事業。
第三大願、 願資生無盡
願我來世得菩提時，以無量無邊智慧方便，令諸眾生皆得無盡所受用物，莫令眾生有所乏少。
第四大願、 願安立大乘
願我來世得菩提時，若諸有情行邪道者，悉令安住菩薩道中；若行聲聞獨覺乘者，皆以大乘而安立之。
第五大願、 願戒行清靜
願我來世得菩提時，若有無量無邊有情，於我法中修行梵行，一切皆令得不缺戒，具三聚戒；設有毀犯，聞我名已，還得清靜，不
墮惡趣。
第六大願、 願諸根完美
願我來世得菩提時，若諸有情其身下劣，諸根不具，醜陋頑愚，盲聾瘖啞，攣躄背僂，白癩癲狂，種種病苦；聞我名已，一切皆得
端正黠慧，諸根完具，無諸疾苦。
第七大願、 願身心康樂
願我來世得菩提時，若諸有情眾病逼切，無救無歸，無醫無藥，無親無家，貧窮多苦，我之名號一經其耳，眾病悉除，身心安樂；
家屬資具，悉皆豐足，乃至證得無上菩提。
第八大願、 願轉女成男
願我來世得菩提時，若有女人為女百惡之所逼惱，極生厭離，願捨女身；聞我名已，一切皆得轉女成男，具丈夫相，乃至證得無上
菩提。
第九大願、 願回邪歸正
願我來世得菩提時，令諸有情出魔罥網，解脫一切外道纏縛；若墮種種惡見稠林，皆為引攝置於正見，漸令修習諸菩薩行，速證無
上正等菩提。
第十大願、 願刑縛解脫
願我來世得菩提時，若諸有情，王法所錄，繩縛鞭撻，繫閉牢獄，或當刑戮，及餘無量災難凌辱，悲愁煎逼，身心受苦；若聞我名
，以我福德威神力故，皆得解脫一切憂苦。
第十一大願、 願得妙飲食
願我來世得普提時，若諸有情，饑渴所惱，為求食故，造諸惡業；得聞我名，專念受持，我當先以上妙飲食，飽足其身，後以法味
，畢竟安樂而建立之。
第十二大願、 願得妙衣具
願我來世得菩提時，若諸有情貧無衣食，蚊蟲寒熱，晝夜逼惱；若聞我名，專念受持，如其所好，即得種種上妙衣服，亦得一切寶
莊嚴具，華鬘塗香，鼓樂眾伎，隨心所翫，皆令滿足。
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